您好！關(guān)于您提出的問題，根據(jù)我國相關(guān)稅法規(guī)定，在轉(zhuǎn)讓不動產(chǎn)時進(jìn)行預(yù)扣預(yù)繳的差額計算，通常是指減去購入價款之后的凈收益。以下是詳細(xì)的解釋：

1. 預(yù)扣預(yù)繳稅款：在不動產(chǎn)轉(zhuǎn)讓過程中，根據(jù)稅法規(guī)定，買方有義務(wù)在支付轉(zhuǎn)讓價款時代扣代繳賣方的應(yīng)納稅款。這里主要涉及個人所得稅和營業(yè)稅。

2. 差額計算：預(yù)扣預(yù)繳的差額通常是指轉(zhuǎn)讓收益減去購入價款。也就是說，計算預(yù)扣預(yù)繳稅款的基礎(chǔ)是轉(zhuǎn)讓不動產(chǎn)所獲得的凈收益。

3. 契稅問題：契稅是在不動產(chǎn)轉(zhuǎn)讓過程中由買方支付的，屬于購買不動產(chǎn)的成本。在計算預(yù)扣預(yù)繳的差額時，通常不考慮契稅。

例如：您購買不動產(chǎn)時的成本為100萬元（含契稅），轉(zhuǎn)讓時售價為150萬元，那么預(yù)扣預(yù)繳的差額計算基礎(chǔ)為50萬元（150萬元 - 100萬元）。

4. 計入成本的契稅：在計算個人所得稅或營業(yè)稅的應(yīng)納稅所得額時，購入不動產(chǎn)時支付的契稅可以作為成本予以扣除。但在預(yù)扣預(yù)繳環(huán)節(jié)，通常不單獨(dú)考慮契稅。

綜上所述，對于您的問題，差額計算在預(yù)扣預(yù)繳時主要是減去購入價款，不包括計入成本的契稅。

希望這個回答能夠解決您的疑問，如有其他問題，請隨時提問。祝您工作順利！