您好！關(guān)于您提出的問題，公司應(yīng)繳納增值稅時(shí)未減去購進(jìn)機(jī)動車支付的收購價(jià)款中的進(jìn)項(xiàng)稅額，這可能是由于以下幾個(gè)原因：

1. **進(jìn)項(xiàng)稅額的適用性**：
- 根據(jù)中國增值稅法的規(guī)定，進(jìn)項(xiàng)稅額是指企業(yè)購進(jìn)貨物、接受服務(wù)時(shí)支付的增值稅，這部分稅額可以用于抵扣銷售時(shí)產(chǎn)生的銷項(xiàng)稅額。但是，并不是所有的進(jìn)項(xiàng)稅額都可以直接用于抵扣，其用途和條件是由稅法明確規(guī)定的。

2. **特定商品的特殊規(guī)定**：
- 對于購進(jìn)的機(jī)動車，可能涉及到一些特殊規(guī)定。例如，如果這些機(jī)動車是用于非增值稅應(yīng)稅項(xiàng)目（如非經(jīng)營性用途），或者是用于簡易計(jì)稅方法計(jì)稅的項(xiàng)目，那么其進(jìn)項(xiàng)稅額可能不能直接用于抵扣。

3. **稅務(wù)處理的具體情況**：
- 若公司是采用一般計(jì)稅方法計(jì)稅，且購進(jìn)的機(jī)動車用于應(yīng)稅項(xiàng)目，正常情況下進(jìn)項(xiàng)稅額是可以抵扣的。如果未抵扣，可能是因?yàn)椋?br> - a. 購進(jìn)的機(jī)動車尚未取得合規(guī)的增值稅專用發(fā)票，或者發(fā)票不符合要求，無法作為抵扣的憑證。
- b. 該筆進(jìn)項(xiàng)稅額已經(jīng)用于其他抵扣，或者是在當(dāng)期的申報(bào)中未能正確申報(bào)。
- c. 可能存在稅務(wù)審計(jì)或自查中發(fā)現(xiàn)的問題，導(dǎo)致該部分進(jìn)項(xiàng)稅額暫時(shí)不能抵扣。

4. **時(shí)間性因素**：
- 進(jìn)項(xiàng)稅額的抵扣還存在時(shí)間限制，必須是在有效期內(nèi)進(jìn)行抵扣。如果超過了規(guī)定的抵扣期限，那么這部分進(jìn)項(xiàng)稅額將不能抵扣。

建議您公司具體核實(shí)以下情況：
- 檢查購進(jìn)機(jī)動車時(shí)取得的增值稅專用發(fā)票是否符合規(guī)定，是否在有效期內(nèi)。
- 核實(shí)該筆進(jìn)項(xiàng)稅額是否已經(jīng)在之前的稅務(wù)申報(bào)中被正確抵扣。
- 咨詢稅務(wù)顧問或稅務(wù)局，確認(rèn)是否有特殊規(guī)定或最新政策變動影響到該筆進(jìn)項(xiàng)稅額的抵扣。

希望我的回答能夠幫助您解決問題，如有其他疑問，請隨時(shí)咨詢。祝工作順利！