尊敬的提問者，您好！關于您的問題，這是因為我國增值稅的征收實行的是“稅不重征”的原則。以下是詳細的解答：

1. 在我國，增值稅是按照貨物或服務的增值額來征稅的。為了避免對一個經(jīng)營環(huán)節(jié)重復征稅，確保稅負公平，我國實行了增值稅進項稅額抵扣制度。

2. 當企業(yè)進口貨物時，通常需要在海關繳納增值稅。這部分在海關繳納的增值稅，實際上是貨物的進項稅額。

3. 企業(yè)在銷售貨物或提供服務時，需要向主管稅務機關繳納增值稅。為了確保稅負公平，避免重復征稅，企業(yè)在計算應繳納的增值稅時，可以從銷售稅額中扣減已繳納的進項稅額，包括在海關處繳納的增值稅。

4. 因此，在向主管稅務機關繳納增值稅時，需要扣減在海關處已交的增值稅，這樣計算出的應納稅額才是準確的，符合稅法規(guī)定。

通過以上解答，希望您能完全理解為什么在向主管稅務機關繳納增值稅時要把在海關處交的扣掉。如果您還有其他問題，歡迎繼續(xù)提問，我會竭誠為您解答。祝您工作順利！