一、稅務(wù)代理機(jī)構(gòu)，是指按規(guī)定條件經(jīng)批準(zhǔn)設(shè)立的注冊稅務(wù)師執(zhí)業(yè)機(jī)構(gòu)——稅務(wù)師事務(wù)所。

二、稅務(wù)機(jī)關(guān)是注冊稅務(wù)師行業(yè)的主管機(jī)關(guān)，它對全國注冊稅務(wù)師行業(yè)行使的是行政管理權(quán)。

三、中國注冊稅務(wù)師協(xié)會是屬于全國性一級社團(tuán)組織，它對行業(yè)實行的是自律性管理，而不具有行政管理權(quán)。

四、區(qū)別主要表現(xiàn)在以下三個方面：
一是從機(jī)構(gòu)的性質(zhì)上看：注冊稅務(wù)師行業(yè)的主管機(jī)關(guān)是稅務(wù)機(jī)關(guān)，其具體承擔(dān)的主管機(jī)構(gòu)是注冊稅務(wù)師管理中心。目前，只在國家稅務(wù)總局和省級稅務(wù)機(jī)關(guān)設(shè)立注冊稅務(wù)師管理中心。國家稅務(wù)總局注冊稅務(wù)師管理中心是國家稅務(wù)總局的內(nèi)設(shè)職能機(jī)構(gòu)，它對全國注冊稅務(wù)師行業(yè)行使的是行政管理權(quán)。中國注冊稅務(wù)師協(xié)會是屬于全國性一級社團(tuán)組織，它對行業(yè)實行的是自律性管理，而不具有行政管理權(quán)。目前，只在國家和省設(shè)立注冊稅務(wù)師協(xié)會。

二是從二者的職能上看：國家稅務(wù)總局注冊稅務(wù)師管理中心的主要職責(zé)是：擬定全國稅務(wù)代理的法規(guī)、制度以及有關(guān)政策，并對執(zhí)行情況進(jìn)行監(jiān)督檢查；對全國注冊稅務(wù)師的執(zhí)業(yè)資格進(jìn)行認(rèn)定、注冊、年檢和其它管理工作；組織編寫注冊稅務(wù)師執(zhí)業(yè)資格考試大綱、考試指定教材，組織命題并協(xié)助有關(guān)部門做好考務(wù)工作；審核、審批稅務(wù)代理機(jī)構(gòu)；查處重大稅務(wù)代理違章案件；做好稅務(wù)代理宣傳、組織國內(nèi)外有關(guān)稅務(wù)代理的聯(lián)絡(luò)、交流和合作活動等事項。中國注冊稅務(wù)師協(xié)會的主要職能是：對注冊稅務(wù)師行業(yè)實行自律性管理。團(tuán)結(jié)、教育執(zhí)業(yè)注冊稅務(wù)師以經(jīng)濟(jì)建設(shè)為中心，促進(jìn)社會主義市場經(jīng)濟(jì)的發(fā)展；保證稅收法律及規(guī)章制度的正確實施；監(jiān)督執(zhí)業(yè)和從業(yè)人員遵守職業(yè)道德，幫助委托人認(rèn)真履行納稅義務(wù)；維護(hù)會員和被代理人的合法權(quán)益；加強會員的聯(lián)系與合作；協(xié)調(diào)執(zhí)業(yè)注冊稅務(wù)師與委托代理人之間的關(guān)系；政府、有關(guān)部門與稅務(wù)代理機(jī)構(gòu)及執(zhí)業(yè)人員發(fā)揮橋梁紐帶作用等。

三是從二者的作用上看：注冊稅務(wù)師管理中心從自己的職能出發(fā)，對注冊稅務(wù)師行業(yè)進(jìn)行管理和監(jiān)督，負(fù)責(zé)審核、報批及審批稅務(wù)師事務(wù)所；對稅務(wù)師事務(wù)所及注冊事務(wù)師的執(zhí)業(yè)行為進(jìn)行監(jiān)督檢查；按規(guī)定的職權(quán)處理違章行為等。注冊事務(wù)師協(xié)會對注冊事務(wù)師行業(yè)通過《注冊稅務(wù)師章程》進(jìn)行自律性管理。承辦會員入會登記、實施行業(yè)指導(dǎo)；開展對執(zhí)業(yè)稅務(wù)師的教育和培訓(xùn)；維護(hù)會員的合法權(quán)益等項事項。