(1)隸屬于財(cái)會(huì)部門：這是最原始最基礎(chǔ)的設(shè)置方式，因而無論從層次、地位和獨(dú)立性來講都是較差的。這種內(nèi)審機(jī)構(gòu)只是開展部分日常性的審計(jì)工作，不能直接為經(jīng)營(yíng)決策者服務(wù)，故不能很好地實(shí)現(xiàn)審計(jì)的根本目的。
(2)隸屬于紀(jì)委或監(jiān)察室：紀(jì)委是黨的辦事機(jī)構(gòu)，而監(jiān)察室屬于行政監(jiān)察機(jī)構(gòu)。因此，將內(nèi)部審計(jì)機(jī)構(gòu)隸屬于紀(jì)委或監(jiān)察室，容易造成黨政不分，政企不分，從而使得內(nèi)部審計(jì)身份職能不明確，因而這種設(shè)置方式不利于內(nèi)部審計(jì)職能的發(fā)揮。
(3)隸屬于總經(jīng)理：這種企業(yè)內(nèi)部審計(jì)組織機(jī)構(gòu)模式是由西方國家發(fā)起的，目前，我們國家也在借鑒。內(nèi)部審計(jì)工作隸屬于總經(jīng)理，使內(nèi)部審計(jì)接近經(jīng)營(yíng)管理層，這確實(shí)有利于為經(jīng)營(yíng)決策服務(wù)，同時(shí)這種設(shè)置方式還能夠使內(nèi)部審計(jì)機(jī)構(gòu)與財(cái)會(huì)等部門相對(duì)獨(dú)立。但是這種設(shè)置不利于內(nèi)審機(jī)構(gòu)對(duì)總經(jīng)理的責(zé)任，業(yè)績(jī)等進(jìn)行獨(dú)立的評(píng)價(jià)和監(jiān)督。因此內(nèi)部審計(jì)機(jī)構(gòu)的這種設(shè)置方式未能使內(nèi)審的地位達(dá)到應(yīng)有的高度，不能完全保證內(nèi)審職能的正常履行。
(4)設(shè)在董事會(huì)：這種組織形式也是在西方國家企業(yè)內(nèi)部審計(jì)組織機(jī)構(gòu)模式中常見的設(shè)置形式之一，董事會(huì)是公司的經(jīng)營(yíng)決策機(jī)構(gòu)，它直接對(duì)股東大會(huì)負(fù)責(zé)。將內(nèi)部審計(jì)組織機(jī)構(gòu)設(shè)在董事會(huì)，有利于保持內(nèi)部審計(jì)較強(qiáng)的獨(dú)立性和較高的地位，同時(shí)也使內(nèi)部審計(jì)具有一定的靈活性，既便于其為委托人服務(wù)，又便于其對(duì)經(jīng)營(yíng)管理層加強(qiáng)管理，提高服務(wù)效益。但不足之處在于，凡事都要通過董事會(huì)集體討論決定，這將降低內(nèi)審工作的效率，不便于內(nèi)審工作的正常履行。